因為問題出在$GLOBALS[navclassid]上面，

首頁測試 使用$GLOBALS[navclassid] 輸出為 1
而換成 [!--self.classid--] 就是 0

這樣解決的，：

頭部添加樣式
<style>
.deannav .tclass[!--self.classid--] a {border-bottom:3px solid #ed6a00;color:#ed6a00}
</style>

下面改成這樣

<nav class="deannav">
      <ul class="header-menu-nav">
        <li class="tclass0"><a href="[!--news.url--]">首頁</a></li>
        <?php
$sql=$empire->query("select classid,classname,islast from {$dbtbpre}enewsclass where bclassid=0 and showclass=0 order by myorder,myorder asc");
    while($s=$empire->fetch($sql)){
            $tclass="tclass".$s[classid];

        $classurl=sys_ReturnBqClassname($s,9);
        echo '<li class="'.$tclass.'"><a href="'.$classurl.'">'.$s[classname].'</a>';
        if(!$s[islast]){
                $sql2=$empire->query("select classid,classname from {$dbtbpre}enewsclass where bclassid=$s[classid] and showclass=0 order by myorder,myorder asc");
            $str="";
            while($s2=$empire->fetch($sql2)){
                    $classurl2=sys_ReturnBqClassname($s2,9);
                    $str.='<li><a href="'.$classurl2.'">'.$s2[classname].'</a></li>';
            }
            echo '<ul class="sub-menu">'.$str.'</ul>';
        }
        echo '</li>';
    }
?>
      </ul>
    </nav>